Sim, os decks vão "se atualizando" durante a campanha, futuramente o Yugi vai começar a
Sempre que você vence um duelo na campanha você destrava uma "Deck Recipe" do personagem derrotado, no caso é a "receita" do deck dele, apenas a "decklist", ao conseguir todas as cartas do deck em questão ele passa a ficar liberado pra você usar em qualquer duelo da campanha ou até mesmo nos "challenge duels", é só escolher jogar com um deck próprio ao invés do deck da história, você também pode criar um deck a partir de um desses decks que você destravou, ou então criar um deck do zero, não precisa jogar com o deck da história, mas eu acho divertido usar os decks dos personagens na campanha.