Acho que o descobrimento seria muito bacana. O primeiro contato dos portugueses com os indígenas, a relação com os jesuítas e o desbravamento dos bandeirantes... Era como descobrir um novo mundo fantástico, quase alienígena, só que na vida real. Foi pelo menos o que os escrivãos da época deixaram nas cartas.
Outro período bacana seria o próprio Império, aquele contato com a urbanização e tecnologias da segunda revolução industrial que só chegaram por aqui nos grandes centros urbanos. Bastante instabilidade política também, revoltas separatistas... Mas talvez ficasse um pouco parecido com Syndicate, já que são períodos contemporâneos.
Eu acho que a ditadura militar seria muito interessante também, mas aí talvez até fuja da proposta mais "histórica" da série, já que não fazem mais de 40 anos do fim. Logicamente iam ter que se aventurar por assuntos políticos espinhosos, mas não que eles não tenham feito em Unity com polêmica do Robespierre também, na própria terra natal, inclusive.